47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4175 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  39.34 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  37.39 
 
 
239 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  37.29 
 
 
240 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  38.4 
 
 
242 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  36.44 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  35.86 
 
 
252 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  35.44 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.48 
 
 
238 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
243 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.48 
 
 
243 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.03 
 
 
243 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.03 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.29 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  31.53 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  29.54 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.3 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.12 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  36.02 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.95 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  34.29 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  39 
 
 
271 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  32.67 
 
 
270 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  23.68 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  41.77 
 
 
256 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  27.56 
 
 
270 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  31.68 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  31.68 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  31.68 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  31.68 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  26.55 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  48.89 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  32.08 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  31.78 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  38.67 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  27.41 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  52.27 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  39.47 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  52.27 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  27.54 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  28.85 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  40.79 
 
 
272 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  38.67 
 
 
257 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  37.8 
 
 
295 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>