40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3990 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  45.86 
 
 
315 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  53.28 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  51.77 
 
 
274 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  54.95 
 
 
273 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  52.61 
 
 
272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  56.25 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  53 
 
 
267 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  48.05 
 
 
266 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  47.37 
 
 
270 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  44.49 
 
 
267 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  44.49 
 
 
267 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  42.41 
 
 
311 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  48.62 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  43.84 
 
 
271 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  37.92 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  36.51 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  37.05 
 
 
272 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  37.92 
 
 
272 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  36.65 
 
 
272 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  36.65 
 
 
272 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  35.15 
 
 
271 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  31.73 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  31.68 
 
 
276 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  32.67 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  26.64 
 
 
322 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  32.49 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  32.03 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  26.58 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  28.79 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  39.36 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  34.38 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  26 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  23.05 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  24.9 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>