40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3635 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  82.22 
 
 
270 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  63.56 
 
 
274 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  61.38 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  58.23 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  56.57 
 
 
272 aa  284  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  47.78 
 
 
315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  48.99 
 
 
267 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  47.17 
 
 
267 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  46.79 
 
 
267 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  49.45 
 
 
271 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  43.23 
 
 
311 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  50.65 
 
 
295 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  48 
 
 
275 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  43.72 
 
 
271 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  37.9 
 
 
272 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  36.69 
 
 
272 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  36.69 
 
 
272 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  36.69 
 
 
272 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  35.89 
 
 
272 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  36.29 
 
 
272 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  36.69 
 
 
272 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  36.69 
 
 
272 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  36.29 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  35.15 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  33.59 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  32.94 
 
 
291 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  32.81 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  29.21 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  32.62 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  24.27 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.29 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  23.66 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  35.96 
 
 
260 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.38 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.04 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.29 
 
 
248 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  24.9 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>