39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2810 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  62.83 
 
 		 272 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  61.34 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  61.34 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  61.34 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  60.61 
 
 		 272 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  62.45 
 
 		 272 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  62.45 
 
 		 272 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  61.34 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  62.45 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  43.7 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  41.9 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  41.6 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  43.12 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  35.15 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  33.73 
 
 		 274 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  36.32 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  32.36 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  31.06 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  32.36 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  33.48 
 
 		 295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  32.67 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  30.26 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  29.74 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  30.8 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  29.31 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  32.34 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  29.43 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  29.3 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  29.2 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  34.82 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  24.73 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.73 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  32.67 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.64 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  31.03 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>