34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06748 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  89.49 
 
 
276 aa  530  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  80 
 
 
291 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  40.51 
 
 
271 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  38.32 
 
 
272 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  38.32 
 
 
272 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  41.9 
 
 
270 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  37.23 
 
 
272 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  37.96 
 
 
272 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  37.23 
 
 
272 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  32.12 
 
 
272 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  32.81 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  33.48 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  33.2 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  32.1 
 
 
267 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  31.53 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  29.26 
 
 
274 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  28.52 
 
 
311 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  30.04 
 
 
271 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  29.27 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  32.48 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  26.94 
 
 
315 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  27.95 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  24.48 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  27.27 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  26.19 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  24.54 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  27.49 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.71 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>