38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0120 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  80 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  78.55 
 
 		 276 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  39.62 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  40.46 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  38.87 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  38.49 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  38.49 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  38.49 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  38.49 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  41.6 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  38.49 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  38.11 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  38.7 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  31.88 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  31.23 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  30.86 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  32.53 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  30.94 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  32.27 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  31.13 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  32.76 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  30.65 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  27.96 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  28.68 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  27.51 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  27.27 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  27.52 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  23.02 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  28.84 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  32 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  29.13 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  23.57 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  28.16 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  23 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>