40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3295 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  99.26 
 
 
272 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  99.26 
 
 
272 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  98.16 
 
 
272 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  90.81 
 
 
272 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  90.07 
 
 
272 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  90.07 
 
 
272 aa  507  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  88.6 
 
 
272 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  87.13 
 
 
272 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  62.45 
 
 
270 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  39.78 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  42.91 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  38.11 
 
 
291 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  37.59 
 
 
276 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  36.76 
 
 
267 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  36.29 
 
 
266 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  36.86 
 
 
272 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  32.17 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  36.73 
 
 
277 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  36.75 
 
 
295 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  33.46 
 
 
270 aa  142  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  34.8 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  32.47 
 
 
267 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  32.1 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  31.65 
 
 
275 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  31.35 
 
 
315 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.52 
 
 
322 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  33.07 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  34.19 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  31.65 
 
 
269 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  30.19 
 
 
267 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  21.33 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  32.11 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  28.15 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  31 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  31 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  31 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>