24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1366 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  35.86 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  34.63 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  33.94 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  34.4 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  33.48 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  34.05 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.4 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.98 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.7 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  35.19 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  31.15 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.97 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  21.77 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  30.2 
 
 		 253 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>