29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2418 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  96.25 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  61.51 
 
 		 239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  61.04 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  56.9 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  37.29 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  34.05 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  29.91 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.96 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.46 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  27.85 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  23.29 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.85 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  25.5 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  28.14 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  29.13 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>