27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2036 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  33.77 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  27.59 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.08 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.47 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.75 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.97 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  27.66 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.81 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  36.8 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  35.56 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  28.21 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  29.73 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.8 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  24.6 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  33.66 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0617  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  27.89 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  26.55 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  28.79 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  28.12 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  29.01 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  29.27 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  29.27 
 
 		 266 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  30.2 
 
 		 252 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>