34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1246 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.1 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  28.04 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.93 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  33.77 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.97 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.21 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.57 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.57 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.8 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.69 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  29.61 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  25.11 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  24.85 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  25.45 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0617  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  29.13 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  23.23 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  26.38 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  35.23 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  24.9 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  28.71 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  23.57 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  22.97 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  25.4 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  25.99 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  38.46 
 
 		 264 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  28.16 
 
 		 272 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  23.21 
 
 		 276 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>