30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1364 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  60.87 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  58.3 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  60.09 
 
 		 256 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  52.92 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  45.56 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  46.43 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  43.95 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  47.33 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  43.78 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  41.2 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  42.29 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  42.68 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  41.43 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  43.04 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  42.97 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  40.08 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  43.78 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  37.8 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  37.77 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  36.46 
 
 		 273 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  36.7 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  36.11 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  37.45 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  35.43 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  31.75 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  34.36 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  52.27 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.45 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>