33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1857 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  554  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  29.39 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  30.57 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  30.57 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  30.19 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  29.67 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  29.81 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  29.85 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  29.21 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  29.21 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  29.2 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  24.34 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  25.84 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  23.02 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  24.54 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  26.73 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  29.02 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  27.32 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  26.23 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  26.23 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  26.78 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  24.27 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  26.46 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  22.65 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  22.94 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  25.27 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  22.98 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  24.04 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  22.22 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.4 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  21.51 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>