36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0985 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  63.43 
 
 
267 aa  358  4e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  63.43 
 
 
267 aa  358  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  58.3 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  58.18 
 
 
272 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  56.91 
 
 
277 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  48.48 
 
 
270 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  53.93 
 
 
271 aa  280  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  48.88 
 
 
266 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  52.21 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  45.21 
 
 
315 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  44.98 
 
 
311 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  52.44 
 
 
295 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  49.6 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  42.8 
 
 
275 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  37.45 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  37.08 
 
 
272 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  37.08 
 
 
272 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  36.03 
 
 
272 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  37.32 
 
 
272 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  35.87 
 
 
272 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  37.32 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  37.32 
 
 
272 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  36.96 
 
 
272 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  37.86 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  35.4 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  33.08 
 
 
276 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  34.73 
 
 
291 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  31.05 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  31.69 
 
 
276 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  35.09 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  31.72 
 
 
205 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  25.62 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.36 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  22.76 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.43 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>