36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12380 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  65.51 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  49.48 
 
 		 274 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  48.62 
 
 		 277 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  48.65 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  48.21 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  46.82 
 
 		 266 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  44.37 
 
 		 267 aa  271  9e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  43.89 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  44.22 
 
 		 270 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  49.08 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  45.02 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  43.83 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  40.6 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  40.89 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  32.5 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  31.97 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  31.63 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  31.63 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  33.02 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  30.94 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  30.94 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  30.63 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  28.92 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  29.01 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  27.15 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  28.17 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  31.28 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  36.72 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  24.04 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  34.29 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  26.49 
 
 		 240 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  26.49 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>