43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1190 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  95.96 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  95.22 
 
 		 272 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  95.22 
 
 		 272 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  88.24 
 
 		 272 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  89.34 
 
 		 272 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  88.6 
 
 		 272 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  87.87 
 
 		 272 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  83.82 
 
 		 272 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  60.61 
 
 		 270 aa  314  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  40.51 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  38.87 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  38.32 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  41.61 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  37.3 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  35.89 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  31.95 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  37.61 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  34.55 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  34.15 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  33.87 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  35.09 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  35.4 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  33.05 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  32.13 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  34.19 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  32.22 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  36.02 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  29.28 
 
 		 322 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  30.71 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  29.67 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  38.98 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  23.63 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  31.68 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  31.19 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 270 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.16 
 
 		 265 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>