34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0428 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  56.65 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  48.34 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  49.08 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  48.13 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  47.92 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  48.63 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  46.72 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  42.8 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  40.8 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  37.36 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  36.6 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  37.36 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  41.91 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  39.6 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  32.41 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  32.28 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  31.89 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  32.28 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  31.89 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  31.13 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  31.17 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  30.12 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  28.68 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  27.56 
 
 		 322 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  28.47 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  27.78 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  21.07 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  28.85 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>