34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1113 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  35.71 
 
 
269 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  33.89 
 
 
267 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  33.89 
 
 
267 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  31.72 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  31.46 
 
 
274 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  30.1 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  32.64 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  33.15 
 
 
270 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  32.08 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  32.62 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  33.69 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  32.55 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  33.88 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  38.98 
 
 
272 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  38.14 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  31.45 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  38.14 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  38.14 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  36.79 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  38.95 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  34.82 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  27.57 
 
 
271 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  28.5 
 
 
322 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  35.77 
 
 
271 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  28.84 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  27.49 
 
 
276 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  27.38 
 
 
266 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.69 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>