37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5638 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  80.07 
 
 		 274 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  59.7 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  56.83 
 
 		 270 aa  328  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  57.55 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  57.09 
 
 		 267 aa  305  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  59.84 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  53.18 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  53.18 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  49.15 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  47.35 
 
 		 311 aa  282  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  51.64 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  54.35 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  49.08 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  47.37 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  36.55 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  36.55 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  36.48 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  36.55 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  36.48 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  34.43 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  36.48 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  34.84 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  32.97 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  33.61 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  32.33 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  34.01 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.38 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  32.59 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.37 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  24.24 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  25 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  31.07 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>