42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1016 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  99.26 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  99.26 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  95.96 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  90.44 
 
 		 272 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  91.54 
 
 		 272 aa  500  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  90.81 
 
 		 272 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  90.07 
 
 		 272 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  84.93 
 
 		 272 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  61.34 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  39.78 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  38.49 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  37.59 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  41.45 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  36.76 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  36.69 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  32.8 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  37.45 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  34.68 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  36.73 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  36.12 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  34.15 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  33.74 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  32.97 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  32.2 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  34.62 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  31.77 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  34.8 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  29.61 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  31.22 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  29.21 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  38.14 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  31.68 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  31.19 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  27.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>