39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2848 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  86.4 
 
 		 272 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  84.93 
 
 		 272 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  84.93 
 
 		 272 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  87.13 
 
 		 272 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  84.19 
 
 		 272 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  86.4 
 
 		 272 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  86.76 
 
 		 272 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  83.82 
 
 		 272 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  61.34 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  39.78 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  43.07 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  40.46 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  38.32 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  37.9 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  32.69 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  35.57 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  37.18 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  35.48 
 
 		 270 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  34.15 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  33.74 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  34.96 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  33.92 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  33 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  30.83 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  32.17 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  32.05 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  30.38 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  27.78 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  36.79 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  34.29 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>