34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5055 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  57.41 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  61.29 
 
 		 274 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  60.89 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  56.6 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  55.76 
 
 		 277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  55.85 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  54.98 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  56.57 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  48.81 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  54.18 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  54.29 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  45.72 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  55.46 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  46.83 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  37.3 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  36.44 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  36.44 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  36.13 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  36.86 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  37.25 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  33.58 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  36.86 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  36.86 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  32.12 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  31.88 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  35.96 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  36.32 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  25.84 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.43 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>