34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3728 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  57.41 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  55.02 
 
 		 274 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  54.62 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  53.25 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  47.41 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  48.15 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  47.41 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  49.45 
 
 		 266 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  52.59 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  50.41 
 
 		 271 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  43.39 
 
 		 315 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  42.57 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  50.22 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  41.67 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  32.97 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  32.22 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  34.87 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  32.17 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  35.25 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  32.66 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  33.62 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  37.44 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  30.65 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.33 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  32.64 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  29.02 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  26.92 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>