46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0140 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  547  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  34.57 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  35.96 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  34.2 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  32.53 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  37.44 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  36.67 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  30.27 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  31.17 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  32.07 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  29.92 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  29.92 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  30.38 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  29.48 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  29.45 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  30.38 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  29.48 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  33.03 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  29.3 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  31.28 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  27.99 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  28.74 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  25.9 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  26.78 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  30.83 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  30.63 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  29.09 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  26.45 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.78 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  27.64 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  28.83 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1112  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956403  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  27.93 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.36 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1639  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  31.75 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>