31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3139 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  63.28 
 
 
256 aa  346  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  62.95 
 
 
272 aa  339  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  63.16 
 
 
257 aa  332  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  58.06 
 
 
256 aa  297  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  54.4 
 
 
256 aa  281  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  52.17 
 
 
283 aa  277  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  53.94 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  53.47 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  49.03 
 
 
267 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  50.2 
 
 
248 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  46.22 
 
 
252 aa  226  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  48.44 
 
 
265 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  46.12 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  45.06 
 
 
274 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  42.97 
 
 
252 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  42.97 
 
 
252 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  45.49 
 
 
256 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  45.45 
 
 
256 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  32.8 
 
 
256 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  37.8 
 
 
266 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  37.1 
 
 
248 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  32.97 
 
 
273 aa  131  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  35.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  32.6 
 
 
379 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  28.62 
 
 
272 aa  82  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  28.26 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  29.05 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  26.45 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  41.77 
 
 
244 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>