36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  64.24 
 
 
315 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  46.85 
 
 
277 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  46.34 
 
 
274 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  45.72 
 
 
272 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  45.45 
 
 
267 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  43.23 
 
 
266 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  45.45 
 
 
267 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  43.15 
 
 
273 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  44.6 
 
 
267 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  40.65 
 
 
270 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  42.57 
 
 
271 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  44.44 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  36.39 
 
 
275 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  40.77 
 
 
271 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  32.69 
 
 
272 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  32.8 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  32.8 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  32.48 
 
 
272 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  31.95 
 
 
272 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  31.85 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  32.48 
 
 
272 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  32.17 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  32.27 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  32.29 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  28.52 
 
 
276 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  30.26 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  27.96 
 
 
291 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  30.26 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  28.23 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  29.45 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  33.88 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  22.22 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  30.22 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  28.14 
 
 
240 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  32.77 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>