35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1712 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1641  putative secreted protein  98.88 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0985  hypothetical protein  63.56 
 
 		 267 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5055  hypothetical protein  55.85 
 
 		 272 aa  301  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5638  hypothetical protein  53.66 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5213  hypothetical protein  53.85 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3635  hypothetical protein  46.79 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  44.03 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2815  hypothetical protein  45.28 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1074  ABC-type transporter, periplasmic component  50.6 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3728  hypothetical protein  47.41 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  45.45 
 
 		 311 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3990  hypothetical protein  48 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  44.94 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0428  hypothetical protein  36.4 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  34.15 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  33.74 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  33.74 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  33.74 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  33.74 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  33.75 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  32.1 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  34.57 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  32.1 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  30.86 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  31.73 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000839  hypothetical protein  31.95 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1114  hypothetical protein  31.73 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0137635  hitchhiker  0.00000000108692 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06748  hypothetical protein  32.1 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  32.36 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3027  hypothetical protein  29.19 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.272415  hitchhiker  0.000171148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  33.89 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1857  hypothetical protein  26.23 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0373875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  25.71 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  28.3 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>