24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5110 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  97.94 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  84.77 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  84.77 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  85.19 
 
 		 243 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  86.42 
 
 		 243 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  49.79 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  48.29 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  36.29 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  33.47 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  27.16 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  29.92 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  27.88 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  33.61 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  26.39 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  26.21 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.62 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  30.37 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  27.73 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  27.4 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  28.48 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  32.97 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0617  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  26.86 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2150  hypothetical protein  23.22 
 
 		 271 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.13443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>