18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3113 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.4 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  29.54 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  30.09 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  31.98 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  29.52 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  31.15 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.73 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.73 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.79 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  27.85 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  27.4 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.71 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0426  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>