More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4461 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4461  major facilitator family transporter  100 
 
 		 430 aa  858    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6405  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 438 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 438 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  38 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  38.92 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  38.92 
 
 		 427 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 436 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.71 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  37.12 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  37.19 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.38 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  39.95 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  39.95 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  39.95 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  38.1 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.1 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  36.36 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  36.36 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  36.12 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 447 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  36.12 
 
 		 430 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.95 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.32 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  37.03 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  37.8 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  38.85 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.95 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.85 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  36.95 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  37.41 
 
 		 499 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  36.96 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  36.79 
 
 		 439 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  36.64 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  38.34 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  39.71 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  35.94 
 
 		 417 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 447 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  35.63 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  36.75 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  34.79 
 
 		 493 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  37.82 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  37.94 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  38.13 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  37.25 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  37.5 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  35.08 
 
 		 489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  35.38 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  34.84 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.03 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  37.53 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  36.1 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  38.01 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  34.8 
 
 		 491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.96 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  38.92 
 
 		 440 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.7 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 495 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  37.09 
 
 		 440 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  35.47 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>