174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0358 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  97.39 
 
 		 115 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  53.61 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  52.04 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  60.49 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  49.51 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  44.44 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  47.66 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  46.15 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  65.62 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  65.62 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  52.38 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  43.56 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  51.25 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  51.9 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  49.53 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  54.12 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  52.94 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  48.81 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  48.28 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  46.51 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  48.75 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  38.32 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  43.21 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  48.72 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  47.89 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  35.78 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  47.44 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  40.23 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  38.14 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  37.37 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  51.72 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  36.78 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  41.18 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 360 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  35.56 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  34.34 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  35.71 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  47.06 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  40.48 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  43.42 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  28.18 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  40.28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  30.1 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  37.8 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  31.87 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  35.37 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  33.02 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  33.67 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  41.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  41.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  42.65 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  30.53 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  42.65 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  23.76 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  31.13 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  30.77 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  36.59 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  29.36 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  29.03 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  34.38 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  32.93 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  29.47 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  33.68 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  28.72 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  36 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  35.11 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  32.97 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  32.08 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  29.52 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  28.16 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  29.7 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  30.84 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  29.47 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  30.53 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  34.15 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  28.83 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  25.96 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  30.59 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  37.35 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  27.1 
 
 		 213 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  31.51 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  27.62 
 
 		 218 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>