175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0359 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  97.96 
 
 		 98 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  60.44 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  56.44 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  55 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  60.92 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  56.47 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  60.76 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  55.68 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  52.94 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  52.33 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  45.88 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  51.19 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  43.75 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  45.88 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  40 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  45.65 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  45.65 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  36.08 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  41.98 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  41.86 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  44.19 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  41.46 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  42.39 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  37.37 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  42.67 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  40.43 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  43.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  49.18 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  49.18 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  44.79 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  45.07 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  42.65 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  38.96 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  39.74 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  43.24 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  38.16 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  36.59 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  38.67 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  40.85 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  35 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  43.1 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  35 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  34.12 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  45.95 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  40.28 
 
 		 221 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  37.33 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  35.44 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  39.53 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  37.93 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  37.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  31.71 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  41.03 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  35.14 
 
 		 190 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  35.48 
 
 		 516 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  34.21 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  35.53 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  35.53 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  38.67 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  35.53 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  34.67 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  34.15 
 
 		 241 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  35.53 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  39.24 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  34.18 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  39.74 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  34.21 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  35.44 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  35.53 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  37.04 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  36.99 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  34.15 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  32.89 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  32.65 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>