152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0591 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  52.53 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  55.81 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  55.81 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  54.65 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  51.69 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  52.94 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  54.84 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  44.32 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  53 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  46.32 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  42.53 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  43.16 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  44.74 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  47.89 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  48.19 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  40.24 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  43.66 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  41.25 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  43.68 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  49.33 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  40.45 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  34.15 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  36.78 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  34.15 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  36.78 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  38.27 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  41.46 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  37.65 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  38.27 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  39.76 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  37.84 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  42.5 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  38.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  38.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  38.55 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  39.13 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  38.55 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  36.14 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  37.35 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  33 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  38.27 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  34.57 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  34.83 
 
 		 204 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  40.62 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  36.05 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  38.75 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  37.31 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  35.9 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  34.57 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  36.47 
 
 		 241 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  31.91 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  34.94 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  35.06 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  31.11 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  35.29 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  34.52 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  36.71 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  38.75 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.88 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  34.52 
 
 		 516 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  34.15 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  35.96 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  33.75 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  31 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  33.75 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>