188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0857 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  73.82 
 
 
192 aa  287  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  73.96 
 
 
196 aa  254  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  61.34 
 
 
195 aa  225  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  61.78 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  42.62 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  42.47 
 
 
196 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  42.54 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  39.68 
 
 
256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  39.47 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  39.68 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  43.43 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  41.18 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  40.5 
 
 
198 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  42.6 
 
 
201 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  39.67 
 
 
204 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  37.97 
 
 
212 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  39.25 
 
 
216 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  38.38 
 
 
270 aa  104  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  39.57 
 
 
215 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  37.5 
 
 
189 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  40.94 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  40.11 
 
 
216 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  39.04 
 
 
213 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  38.3 
 
 
231 aa  101  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  39.57 
 
 
216 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  36.76 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  37.11 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  40.83 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  36.92 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  34.38 
 
 
360 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  38.14 
 
 
238 aa  94.4  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  37.99 
 
 
187 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  36.71 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  34.39 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  38.14 
 
 
239 aa  92  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35.4 
 
 
185 aa  91.3  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  36.26 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  35.52 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  35.52 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  32.45 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  35.87 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  29.72 
 
 
248 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  36.22 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  33.88 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  35.11 
 
 
191 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  36.87 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  34.57 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.96 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  34.66 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  31.38 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  35.52 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  37.02 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  35.39 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  38.12 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  34.04 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  36.02 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  36.76 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.46 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  32.09 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  33.51 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  33.51 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  31.69 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.9 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.97 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  33.71 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  31.89 
 
 
241 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.67 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  31.64 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  33.89 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  33.01 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  32.43 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.04 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.2 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.2 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.04 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  34.43 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  32.61 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  33.71 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  35.14 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  33.71 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  34.81 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  34.81 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  31.49 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  31.49 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  35.16 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  34.1 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  34.1 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>