189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1174 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  74.36 
 
 		 192 aa  284  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  73.96 
 
 		 192 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  58.16 
 
 		 195 aa  222  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  60.82 
 
 		 195 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  42.7 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  40.1 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  37.43 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  40.34 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  42.77 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  38.95 
 
 		 261 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  37.3 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  40.7 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  39.89 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  37.7 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  36.27 
 
 		 270 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  38.46 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  37.1 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  39.78 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  39.38 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  37.3 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  36.02 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  38.17 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  37.1 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  37.1 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  36.84 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  39.38 
 
 		 219 aa  97.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  35.6 
 
 		 216 aa  97.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  38.42 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  36.22 
 
 		 216 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  36.9 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  37.7 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  35.68 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  31.52 
 
 		 235 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  36.41 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  36.17 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  30.64 
 
 		 248 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  35.33 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  34.36 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  36.76 
 
 		 235 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  32.97 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  38.12 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  35.56 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  38.12 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  34.59 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  33.52 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.89 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  36.22 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  32.04 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  36.22 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  38.12 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  32.97 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  32.8 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  32.97 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.15 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  33.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  30.81 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  31.19 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.24 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  33.69 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  32.8 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  34.24 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  32.97 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  36.21 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  34.04 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.43 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  32.29 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.43 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  32.62 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  31.38 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  32.04 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.78 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  34.43 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  32.97 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33.87 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  32.97 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  32.97 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  37.2 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  34.05 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>