156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2302 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  62.5 
 
 
138 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  61.39 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  57.73 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  61.36 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  54.21 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  73.13 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  73.13 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  45.45 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  49.47 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  47 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  43.4 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  52.56 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  42.86 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  44.66 
 
 
108 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  45.35 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  45.1 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  38.46 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  46.67 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  43.27 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  39.29 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  35.92 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  34.88 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  48.65 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  54.1 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  45.83 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  41.3 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  39.77 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  40.22 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  38.38 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  36.9 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  34.91 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  41.67 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  40.23 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  46.38 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  49.32 
 
 
201 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  38.14 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.69 
 
 
203 aa  57.4  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  31.67 
 
 
241 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  34.95 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  44.93 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  30.19 
 
 
194 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  33.02 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  28.8 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  33.64 
 
 
197 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  40.54 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  32.99 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  33.64 
 
 
204 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  29.25 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  34.12 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  29.25 
 
 
194 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  30.56 
 
 
234 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  32.35 
 
 
198 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  35.56 
 
 
199 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  31.63 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  26.21 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  32.35 
 
 
198 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  32.35 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  39.51 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  33.02 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  33.64 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  32.04 
 
 
270 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  31.18 
 
 
360 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  29.63 
 
 
191 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  31.78 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.56 
 
 
204 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  38.27 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  32.71 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  35.24 
 
 
261 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  35 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  28.18 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  28.18 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.19 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  29.36 
 
 
206 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  29.7 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  29.59 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  29.63 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  30.61 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  31.78 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  38.61 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  28.16 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  39.47 
 
 
200 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  29.7 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  32 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  29.7 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  29.7 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  29.41 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>