156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0973 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 
90 aa  173  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  46.34 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  46.25 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  46.25 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  46.84 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  43.53 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  44.44 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  43.68 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  42.7 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  40.66 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  43.21 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  45 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  50 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  43.21 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  46.51 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  40.96 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  45.07 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  45.07 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  48.48 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  44.3 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  41.77 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  37.08 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  37.35 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  40.85 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  42.65 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  38.46 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  41.46 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  41.98 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  44.62 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  44.62 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  36.25 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  36.78 
 
 
188 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  41.98 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  38.75 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  38.75 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 
195 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  35.62 
 
 
360 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  37.5 
 
 
238 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  36.49 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  37.04 
 
 
196 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  35.14 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  33.71 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  33.71 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  44.16 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  35.71 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  41.33 
 
 
205 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  40.58 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  44.44 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  41.33 
 
 
201 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  39.24 
 
 
193 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  29.55 
 
 
201 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  38.75 
 
 
196 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  35.16 
 
 
194 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  41.38 
 
 
216 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  32.91 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  31.65 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  42.65 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  41.3 
 
 
261 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  33.78 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  41.57 
 
 
256 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  37.66 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  33.78 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  39.47 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  33.78 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  34.62 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  31.46 
 
 
206 aa  47.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  35.14 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  28.17 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  34.48 
 
 
235 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35.9 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  35.21 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  31.33 
 
 
239 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  34.67 
 
 
183 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  34.57 
 
 
215 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  29.55 
 
 
195 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  29.21 
 
 
191 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  39.51 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  27.59 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  40.74 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  27.59 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.38 
 
 
204 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  34.15 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  31.76 
 
 
220 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  26.44 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  39.29 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  32.43 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  32.43 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  32.95 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>