157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0447 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  62.03 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  58.82 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  57.61 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  58.7 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  58.15 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  58.15 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  57.07 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  56.91 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  57.75 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  58.01 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  59.66 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  51.09 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  50.54 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  54.55 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  50.54 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  51.32 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  52.51 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  51.4 
 
 		 218 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  51.4 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  51.4 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  55.8 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  50.81 
 
 		 218 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  50.81 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  51.4 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  51.35 
 
 		 190 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  51.37 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  57.46 
 
 		 191 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  49.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  51.63 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  53.8 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  52.94 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  53.11 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  54.89 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  53.11 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  58.89 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  55.25 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  52.25 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  49.16 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  49.19 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  49.19 
 
 		 191 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  49.73 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  52.22 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  48.89 
 
 		 196 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  51.85 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  50.26 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  50.79 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  47.28 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  53.04 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  49.46 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  45.36 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  48.37 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  51.56 
 
 		 241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  53.25 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  45.3 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  47.8 
 
 		 186 aa  158  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  46.45 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  43.65 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  45.99 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  47.06 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  46.52 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  55.8 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  46.52 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  47.06 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  51.32 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  50.89 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  51.83 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  52.63 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  46.24 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  37.78 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  37.57 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  37.78 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  35.56 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  35.56 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.24 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  39.78 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  39.46 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  37.57 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  36.98 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  36.46 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  35 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  36.46 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>