164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1160 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  81.9 
 
 		 105 aa  157  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  79.31 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  66.29 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  67.44 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  57.95 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  52.27 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  66.22 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  53.41 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  53.41 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  52.94 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  55 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  55 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  46.53 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  45.65 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  48.86 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  48.81 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  48.81 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  44.32 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  60.34 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  52.56 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  43.68 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  45.05 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  44.94 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  51.14 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  45.63 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  42.7 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  54.1 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  42.05 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  40.59 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  42.53 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  41.77 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  43.06 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  51.67 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  51.67 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  40.4 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  35.63 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  56.86 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  39.08 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  45.57 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  34.88 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  37.93 
 
 		 195 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  34.57 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  50.91 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  36.84 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  36.84 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  37.84 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  40.48 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  31.25 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  38.67 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  33.75 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  37.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  37.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  38.81 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  33.75 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  41.46 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  33.75 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  36.49 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  37.93 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  40 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  37.97 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  33.98 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.88 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  48.33 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  36.49 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  36.49 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  37.33 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  32.47 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  34.88 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  33.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  33.77 
 
 		 188 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  35 
 
 		 216 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  36.71 
 
 		 241 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33.77 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>