91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6182 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  46.37 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  47.39 
 
 		 198 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  42.92 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  41.7 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  38.31 
 
 		 360 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  36.4 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  35.22 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  57.89 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  34.41 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  36.78 
 
 		 205 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  29.72 
 
 		 192 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  28.87 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  30.53 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  31.05 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  28.69 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  46.97 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  32.84 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  23.21 
 
 		 207 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  30.84 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  32.66 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  35.04 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  28.57 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  30.11 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  28.16 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  29.96 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  41.89 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  33.75 
 
 		 104 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  34.48 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  30.93 
 
 		 115 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  30.93 
 
 		 115 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  29.96 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  27.4 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  22.67 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  29.96 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  38.1 
 
 		 122 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  35.42 
 
 		 110 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  34.31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  41.03 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  43.75 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  32.73 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  36.78 
 
 		 116 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  30.11 
 
 		 516 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  24.26 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  27.24 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  30.21 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  23.77 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  33.66 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  33 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  26.45 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  23.46 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  30.43 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  36.56 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  39.47 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  32.76 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  29.06 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  29.59 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  33.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  25.1 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  37 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  34.41 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  33.98 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  32.5 
 
 		 93 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  30.85 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  23.53 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  31.25 
 
 		 93 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  35.44 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  33.01 
 
 		 105 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  35.9 
 
 		 103 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  28.69 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  23.05 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  23.83 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  33.77 
 
 		 126 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  41.79 
 
 		 124 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  33.77 
 
 		 126 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  23.14 
 
 		 191 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  25.64 
 
 		 216 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>