138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0167 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  53.09 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  44.56 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  46.82 
 
 		 360 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  35.02 
 
 		 248 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  46.24 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  41.87 
 
 		 239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  40.84 
 
 		 270 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  37.19 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.11 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  34.54 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  37.23 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  36.16 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  32.32 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  34.68 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  36.52 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  32.04 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  33.13 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  34.19 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  34.81 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  32.95 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  32.98 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  29.53 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  28.14 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  27.06 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  29.27 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  30.6 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  27.75 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  30.61 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  26.47 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  30.56 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  31.46 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  31.46 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  35.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  31.46 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  31.46 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  28.57 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  31.03 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  32.32 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  31.55 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  30.73 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  34.13 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  31.02 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  29.27 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  31.76 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  26.86 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  32.04 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  29.82 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  30.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  29.48 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  29.31 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  27.96 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  30.05 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  24.47 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  27.27 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  30.81 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  29.3 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  32.35 
 
 		 115 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  28.49 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  31.55 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  30.06 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  43.08 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  29.78 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  32.29 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  34.57 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  26.14 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  27.89 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  26.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.88 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  28.06 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  27.91 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  30.27 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  28.09 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  28.98 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  27.72 
 
 		 121 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  30.34 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  32.56 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  36.71 
 
 		 126 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  36.71 
 
 		 126 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  35.37 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  43.08 
 
 		 116 aa  45.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>