123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6052 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  44.13 
 
 		 207 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  48.82 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  44.08 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  41.46 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  43.17 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  40.55 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  36.12 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  39.22 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  32.35 
 
 		 302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  38.21 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  33.63 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  27.7 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  27.7 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  27.7 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  27.23 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  28.17 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  33.8 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  27.05 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  25.71 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  30.19 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  25.47 
 
 		 270 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  30.14 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  26.79 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  28.23 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  23.81 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  25.73 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  27.45 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  26.54 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  26.7 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  24.53 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  24.53 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  23.15 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  25.47 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  23.39 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  27.8 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  25.37 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  23.81 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  27.49 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  27.49 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  23.36 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  24.75 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  23.67 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  27.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  25.82 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  23 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  23.47 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  26.05 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1664  protein of unknown function UPF0016  24.88 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  23 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  26.85 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  27.4 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  24.74 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  27.49 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  25.12 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  28.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  24.53 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  22.6 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  24.53 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  24.53 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  25.82 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  25.82 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  26.92 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  27.62 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  24.77 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  21.13 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  22.6 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  25.12 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  24.41 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  41.43 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  27.36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  29.59 
 
 		 121 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  28.28 
 
 		 115 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  22.51 
 
 		 302 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  32.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  32.99 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  21.86 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  23.47 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  37.68 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  20.2 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  29.17 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>