153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13884 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  100 
 
 
302 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  59.36 
 
 
235 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  59.36 
 
 
235 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  61.88 
 
 
235 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  47.98 
 
 
256 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  45.27 
 
 
261 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  45.8 
 
 
238 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  47.31 
 
 
235 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  47.25 
 
 
196 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  43.89 
 
 
189 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  45.7 
 
 
195 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  45.7 
 
 
194 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  45.56 
 
 
218 aa  142  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  46.91 
 
 
185 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  45.65 
 
 
192 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  40.39 
 
 
216 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  40.69 
 
 
216 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  42.11 
 
 
216 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  41.14 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  41.94 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  39.71 
 
 
213 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  36.87 
 
 
215 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  36.48 
 
 
231 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  39.44 
 
 
212 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  35.75 
 
 
192 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  34.57 
 
 
204 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  38.33 
 
 
218 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  38.33 
 
 
218 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  39.05 
 
 
187 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  38.25 
 
 
190 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  39.05 
 
 
205 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  38.25 
 
 
190 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  38.12 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  38.12 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  38.12 
 
 
218 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  35.11 
 
 
192 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  35.11 
 
 
192 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.18 
 
 
186 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.63 
 
 
192 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  38.25 
 
 
190 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  39.05 
 
 
187 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  33.52 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  36.96 
 
 
190 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  36.32 
 
 
195 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  31.69 
 
 
191 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  33.9 
 
 
196 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  36.65 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  32.61 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  32.24 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  34.25 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  30.85 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  32.79 
 
 
204 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  32.24 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  33.7 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.2 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  33.87 
 
 
201 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  32.79 
 
 
187 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  31.02 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  38.12 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  32.39 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  32.2 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  34.39 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  31.28 
 
 
203 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  31.77 
 
 
195 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  32.75 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  28.96 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  28.8 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  32.58 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  34.27 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  30.34 
 
 
184 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  33.52 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  32.24 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  31.69 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  31.03 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  30.27 
 
 
188 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.79 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  32.42 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  33.15 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  30.22 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  36.75 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  33.88 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>