189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1157 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  73.82 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  72.31 
 
 		 196 aa  257  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  57.22 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  61.26 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  45.2 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  44.39 
 
 		 261 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  43.85 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  39.78 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  43.48 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  38.38 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  39.67 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  38.74 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  41.3 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  39.77 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  37.06 
 
 		 360 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  42.69 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  40.11 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  37.69 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  41.42 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  37.43 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  36.87 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  39.23 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  38.33 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  37.22 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  39.68 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  34.41 
 
 		 248 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  38.42 
 
 		 238 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.12 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  40.24 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  36.18 
 
 		 270 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  38.34 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  37.36 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  37.43 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  37.97 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  34.54 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  39.61 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  38.34 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  35.36 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  33.88 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  33.88 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  30.89 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  33.15 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  37.82 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  34.22 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  34.62 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  35.03 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  36.63 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  34.45 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  35.79 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  35.5 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.95 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  34.07 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  32.45 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  34.95 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  31.67 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  34.97 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.65 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.02 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  35.26 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  35.26 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  30.77 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.89 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  30.6 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  34.27 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  35.68 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.79 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  33.87 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  34.05 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  32.12 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  32.11 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  32.11 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  29.23 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  36.9 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.78 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  31.96 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  31.02 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.46 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  32.43 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  32.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  32.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  29.02 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>