169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1390 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  83.33 
 
 		 216 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  81.52 
 
 		 213 aa  354  6.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  77.93 
 
 		 218 aa  343  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  74.31 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  68.54 
 
 		 215 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  67.62 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  57.87 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  54.05 
 
 		 256 aa  184  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  54.55 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  51.89 
 
 		 189 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  51.37 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  51.6 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  50.84 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  48.59 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  51.63 
 
 		 238 aa  167  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  46.39 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  46.24 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  52.38 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  51.45 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  44.05 
 
 		 302 aa  128  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  39.22 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  39.22 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  41.27 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  36.51 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  36.32 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  37.57 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  37.17 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  36.72 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.04 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  38.25 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  34.04 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  36.08 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  37.22 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  36.56 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  35.91 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  36.07 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  34.72 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  36.07 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  38.95 
 
 		 189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  36.16 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  35.79 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  35.52 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  35.91 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  37.57 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  35.79 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  36.41 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  35.48 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  38.46 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  35.59 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  34.43 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  39.11 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  39.67 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  34.59 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  40.11 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33.69 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  36.17 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  34.41 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  34.97 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  35.52 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  33.68 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  36.96 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  36.22 
 
 		 186 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  33.87 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  34.81 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  33.88 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  34.41 
 
 		 194 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  35.87 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  35.87 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  33.69 
 
 		 188 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  35.87 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  38.33 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  35.87 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  33.87 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  34.22 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  34.81 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  32.11 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  34.97 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  35.68 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  34.81 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  31.15 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  36.9 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>