163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3666 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  89.12 
 
 		 193 aa  291  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  75.52 
 
 		 194 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  77.6 
 
 		 194 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  78.65 
 
 		 194 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  76.04 
 
 		 194 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  73.96 
 
 		 194 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  87.05 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  77.08 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  77.08 
 
 		 194 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  91.41 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  60.82 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  62.22 
 
 		 203 aa  222  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  62.78 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  59.34 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  60.99 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  60.56 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  58.6 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  58.79 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  58.06 
 
 		 192 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  60.57 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  59.02 
 
 		 188 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  59.78 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  59.44 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  60.77 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  59.32 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  58.76 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  57.07 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  58.33 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  58.33 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  58.33 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  58.33 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  57.78 
 
 		 184 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  55.49 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  55.43 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  54.95 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  57.78 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  57.14 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  58.38 
 
 		 184 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  55.49 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  56.91 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  54.89 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  53.8 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  55.49 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  54.35 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  53.85 
 
 		 234 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  58.56 
 
 		 191 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  53.71 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  55.85 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  58.48 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  53.14 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  54.95 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  57.78 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  57.69 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  59.44 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  56.35 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  58.89 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  58.89 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  55.43 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  58.89 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  53.51 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  57.22 
 
 		 197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  52.11 
 
 		 191 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  54.44 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  55.43 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  51.31 
 
 		 191 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  54.1 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  51.34 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  55.68 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  50.83 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  47.78 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  56.35 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  47.87 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  50.29 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  44.83 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  46.41 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  47.87 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  38.1 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  36.79 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  35.48 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  42.22 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  60.82 
 
 		 102 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  34.55 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  37.11 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  37.7 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  35.26 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  36.72 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  36.99 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  35.67 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  38.59 
 
 		 256 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  35 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>