162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5046 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  56.17 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  50.21 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  55.26 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  52.38 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  44.49 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  51.35 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  48.66 
 
 		 195 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  49.73 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  39.15 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  43.68 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  39.21 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  45.36 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  41.27 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  46.84 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  45.74 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  42.33 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  48.15 
 
 		 185 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  38.16 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  42.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  41.44 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  37.78 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  36.67 
 
 		 187 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  36.11 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  37.16 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  37.22 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  37.16 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  36.96 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  36.61 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  36.96 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  37.16 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  36.51 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  35.56 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  31.53 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  36.61 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  35.98 
 
 		 190 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  35.48 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  35.48 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.87 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  35.26 
 
 		 192 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  33.51 
 
 		 192 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  33.51 
 
 		 192 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  33.85 
 
 		 191 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  31.58 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  33.7 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  35.64 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  35.68 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  31.05 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  32.78 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  32.22 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.77 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  32.42 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  33.71 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  32.77 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  35 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  29.95 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  31.05 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  30.46 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  32.07 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  31.28 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  31.49 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  32.79 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  32.91 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  33.51 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  30.06 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  32.62 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  32.8 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  31.84 
 
 		 196 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  28.34 
 
 		 183 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  28.09 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  27.5 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  34.54 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  33.53 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  34.59 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  32.82 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  35.14 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  30.98 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  29.83 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  32.6 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>