167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5105 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  68.91 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  57.14 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  56.63 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  57.89 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  57.38 
 
 		 256 aa  188  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  55.79 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  53.85 
 
 		 235 aa  185  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  57.92 
 
 		 261 aa  184  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  58.05 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  53.11 
 
 		 231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  51.41 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  52.54 
 
 		 216 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  49.15 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  54.64 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  51.41 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  56.6 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  50.28 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  46.89 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  48.59 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  42.24 
 
 		 302 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  45.2 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  42.62 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  41.76 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  40.57 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  41.85 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  41.14 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  37.63 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  41.92 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  38.89 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  40.57 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  41.18 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  38.67 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  38.67 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  38.59 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  39.31 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  38.73 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  38.67 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  41.18 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  36.26 
 
 		 219 aa  98.6  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  38.67 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  38.67 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  38.04 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  39.78 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  38.38 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  35.84 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  40.59 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  36.57 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  36.46 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  40.34 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  37.06 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  39.11 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  36.26 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  35.39 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  38.29 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  40.59 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  35.39 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  36.52 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  36.22 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  37.71 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  35.68 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  36.21 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  32.26 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  36.16 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  40.23 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  36.16 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  36.26 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  34.83 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  34.83 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  34.94 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  36.22 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  35.56 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  35.33 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  35.14 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  36.47 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  35.88 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  35.22 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.07 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  33.72 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  39.23 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  33.89 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  38.22 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  33.89 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>