169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6459 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  718    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  51.27 
 
 
199 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  44.16 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  47.13 
 
 
199 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  42.41 
 
 
239 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  41.41 
 
 
198 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  46.82 
 
 
196 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  37.06 
 
 
192 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  42.78 
 
 
205 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  43.41 
 
 
198 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  34.38 
 
 
192 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  51.02 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  37.08 
 
 
196 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  36.76 
 
 
195 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  35.68 
 
 
188 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  34.44 
 
 
195 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  34.24 
 
 
190 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  34.3 
 
 
221 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  34.97 
 
 
234 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  34.46 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  33.88 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  35 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  36.27 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.18 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  32.97 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  33.88 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  33.88 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  34.18 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  34.78 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  31.63 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  34.78 
 
 
231 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  38.02 
 
 
195 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  38.67 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  31.61 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  32.11 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  31.62 
 
 
238 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  29.29 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  37.56 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  34.81 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  32.79 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.71 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32.07 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.81 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  28.79 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  31.94 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  32.8 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  28.73 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  34.24 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  33.7 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  34.43 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.62 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.27 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  30.61 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  34.62 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  34.72 
 
 
204 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  32.43 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  35.26 
 
 
212 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  34.12 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  31.09 
 
 
187 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  34.43 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  43.16 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  31.91 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  34.22 
 
 
194 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33.14 
 
 
194 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  32.18 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  32.77 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  31.38 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  31.22 
 
 
230 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  30.05 
 
 
195 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  32.63 
 
 
187 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  29.78 
 
 
191 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  30.34 
 
 
235 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  35.26 
 
 
196 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  32.2 
 
 
184 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  31.55 
 
 
192 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  31.58 
 
 
256 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  30.96 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  29.67 
 
 
191 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  31.69 
 
 
216 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  28.02 
 
 
184 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.56 
 
 
191 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  30.53 
 
 
205 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  33.69 
 
 
194 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.2 
 
 
191 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.38 
 
 
189 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>