50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0015 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  62.14 
 
 
247 aa  288  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  60.24 
 
 
232 aa  277  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  30.65 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  34.78 
 
 
185 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  24.88 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  35.23 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  39.77 
 
 
188 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  36.9 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  26.5 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  25.71 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  35.56 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  30.27 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  33.7 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  34.44 
 
 
198 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  28.84 
 
 
199 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  34.15 
 
 
190 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  34.44 
 
 
184 aa  45.4  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  39.74 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  36.56 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  34.44 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  31.46 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  30.23 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  32.61 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  31.71 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  26.19 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  26.17 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  37.36 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  37.36 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  38.46 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  38.46 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  24.86 
 
 
196 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  32.61 
 
 
184 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  38.46 
 
 
190 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  37.8 
 
 
190 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>